1994年に登場したグループで、流鉄で最初の冷房付電車です。2000形が4本導入されたのち、3000形が2本やってきました。全編成が引退済みです。

大きなポイントとしては、6編成すべて「顔」の見た目はほぼ同じであるものの、基になった車種が3系列あり、それによって第二世代の中で2形式に分かれているということ。また基車は4両編成のため、3両・2両編成化時に中間車だったモハへ運転台を移設するいわゆる「先頭車化改造」工事を受けているというところも第二世代の特徴です。

ワンマン運転開始と輸送力過剰に伴い、ワンマン運転に対応しなかった3両編成電車が先に廃車されていきました。ワンマン化改造された2両編成も老朽化など（当時の日中や土日は基本的に2両編成が多用されており、そのぶん2編成に疲労が蓄積していたと思われます）により、第三世代の5000形に置き換えられるかたちで引退しました。